Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp1P29452 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp1P29452 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp1P29452 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp1P29452 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp1P29452 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp1P29452 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp1P29452 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms