Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmb9P28076 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms