Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm3P21107 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpm3P21107 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.2 ms