Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18525 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18525 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18525 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18525 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18525 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18525 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18525 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18525 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P18525 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18525 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18525 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18525 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18525 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18525 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18525 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18525 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18525 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18525 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms