Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtpraP18052 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpraP18052 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PtpraP18052 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpraP18052 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PtpraP18052 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtpraP18052 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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