Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lynx1P0DP60 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lynx1P0DP60 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms