Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc1P02468 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc1P02468 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms