Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm3488M0QW81 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm3488M0QW81 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms