Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm21900J3QP38 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21900J3QP38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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