Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bbip1J3QMK2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbip1J3QMK2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms