Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r68E9Q0V3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms