Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brpf1B2RRD7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brpf1B2RRD7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms