Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp42B2RQC2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp42B2RQC2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp42B2RQC2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms