Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Scn7aB1AYL1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn7aB1AYL1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms