Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80eA0A0U1RP99 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ino80eA0A0U1RP99 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.2 ms