Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms