Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nme3Q9WV85 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nme3Q9WV85 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms