Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnckQ9QYK9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PnckQ9QYK9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms