Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bcl11aQ9QYE3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11aQ9QYE3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11aQ9QYE3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms