Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk1eQ9JMK2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk1eQ9JMK2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms