Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col5a3Q9JLI2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col5a3Q9JLI2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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