Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hmgn5Q9JL35 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmgn5Q9JL35 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms