Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sv2aQ9JIS5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sv2aQ9JIS5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sv2aQ9JIS5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms