Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tfcp2Q9ERA0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms