Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SgshQ9EQ08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SgshQ9EQ08 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms