Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ubiad1Q9DC60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubiad1Q9DC60 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubiad1Q9DC60 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms