Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc105Q9D4K7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms