Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402E13RikQ9D4D2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402E13RikQ9D4D2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms