Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spns3Q9D232 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spns3Q9D232 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms