Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serpinb3bQ9D1Q5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms