Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG9

Pdzd11, PDZ domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd11Q9CZG9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd11Q9CZG9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd11Q9CZG9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd11Q9CZG9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd11Q9CZG9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd11Q9CZG9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pdzd11Q9CZG9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdzd11Q9CZG9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd11Q9CZG9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms