Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd1Q9CR42 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd1Q9CR42 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd1Q9CR42 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 611.8 ms