Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufb5Q9CQH3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ndufb5Q9CQH3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ndufb5Q9CQH3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms