Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trpd52l3Q9CQ14 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms