Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl27Q99N92 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl27Q99N92 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl27Q99N92 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl27Q99N92 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl27Q99N92 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl27Q99N92 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl27Q99N92 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl27Q99N92 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms