Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca3Q99M54 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca3Q99M54 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca3Q99M54 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca3Q99M54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca3Q99M54 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca3Q99M54 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca3Q99M54 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdca3Q99M54 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca3Q99M54 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca3Q99M54 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdca3Q99M54 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca3Q99M54 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdca3Q99M54 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms