Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TriobpQ99KW3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TriobpQ99KW3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TriobpQ99KW3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TriobpQ99KW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TriobpQ99KW3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TriobpQ99KW3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TriobpQ99KW3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms