Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rnf34Q99KR6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf34Q99KR6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf34Q99KR6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms