Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cep57l1Q8VDS7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cep57l1Q8VDS7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cep57l1Q8VDS7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms