Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd3Q8K2F0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Brd3Q8K2F0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Brd3Q8K2F0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms