Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Spire2Q8K1S6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spire2Q8K1S6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spire2Q8K1S6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Spire2Q8K1S6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spire2Q8K1S6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spire2Q8K1S6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms