Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc9Q8CDN9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Lrrc9Q8CDN9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lrrc9Q8CDN9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms