Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lancl3Q8CD19 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lancl3Q8CD19 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms