Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp1Q8C8U0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfibp1Q8C8U0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfibp1Q8C8U0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms