Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc30Q8BVF4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc30Q8BVF4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc30Q8BVF4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms