Protein–RNA interactions for Protein: Q810R8

Gm20738, Predicted gene, 20738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20738Q810R8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm20738Q810R8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm20738Q810R8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20738Q810R8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms