Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ttll4Q80UG8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll4Q80UG8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms