Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup214Q80U93 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup214Q80U93 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms