Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim17Q7TPM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim17Q7TPM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim17Q7TPM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms