Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ptx4Q6RUU0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ptx4Q6RUU0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ptx4Q6RUU0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms